นักเรียนโรงเรียนกำเนิดวิทย์รุ่นที่ 1 และรุ่นที่ 2 ได้เข้าร่วมการแข่งขันฟิสิกส์โอลิมปิก ระดับชาติ ครั้งที่ 15 (The Fifteen Thailand Physics Olympiad : 15th TPhO) เมื่อวันที่ 2–6 มิถุนายน 2559 ณ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ วิทยาเขตปัตตานี ในนามศูนย์มหาวิทยาลัยบูรพา จำนวน 3 คน และได้รางวัลทั้ง 3 คน ดังนี้
เหรียญทอง และ รางวัลคะแนนสูงสุดของภาคตะวันออก
1. นางสาวอาทิตยา บุญเกิด (ในนามโรงเรียนกำเนิดวิทย์)
เหรียญทองแดง
1. นายสราวุฒิ สิรโฆษิต (ในนามโรงเรียนกำเนิดวิทย์)
เหรียญทอง
1. นายลภัส เปรมเจริญ (ในนามโรงเรียนจุฬาภรณราชวิทยาลัย ชลบุรี)
